非氧化性杀菌灭藻剂的杀生作用有一定的持久性，对沉积物或黏泥有渗透、剥离作用，受硫化氢、氨等还原物质的影响较小，受水中PH值影响较小。但处理费用相对氧化性杀菌灭藻剂较高，容易引起环境污染，水中的微生物易产生抗药剂型。

      有机胺类杀菌剂广泛地用来控制冷却水中的微生物，具有杀菌作用强，能杀死大多数微生物，还有相当良好的渗透能力和分散能力，与大多数水质稳定剂和处理剂中的化学药剂相容，能在较宽的PH值范围内使用，以及对鱼类等的毒性小，易降解，较少的环境污染等优点。其中季铵盐应用范围广并具有典型性。